Algorithmique de la bio-informatique
Sessions de formation
(Fuseau horaire : Europe/Paris)
Centre Cnam Paris - Formation 2nd Semestre en présentiel
La période de cours est planifiée du 03/02/2025 au 07/06/2025
L'inscription est ouverte jusqu'au 14/03/2025 17:00
Présentation
Public, conditions d'accès et prérequis
Prérequis : Les auditeurs devront de préférence avoir assisté au cours BNF102 ou sinon justifier d'un niveau suffisant en programmation
Biologistes ou Informaticiens.
Titulaires d'un BTS de Biochimie, Biotechnologie, Biologie ou d'un DUT de Biologie appliquée (ou diplômes équivalents bac+2)
Titulaire d'un BTS ou d'une licence d'informatique ou diplôme de niveau équivalent.
Objectifs
Initier aux algorithmes utilisés pour les principaux programmes de bio-informatique.
Contenu
1) Bases algorithmiques
2) Alignements multiples et recherche de motifs
3) Recherche de similarités dans les banques : BLAST et FASTA
4) Assemblage de séquences et présentation de logiciels
5) Automates et expressions régulières
6) Recherche de gènes : méthodes heuristiques
Bibliographie
| Titre | Auteur(s) |
|---|---|
| Bioinformatics | AD Baxevanis et al. Wiley Interscience New York (USA) |
| Initiation à la programmation et aux algorithmes (Scheme) | L. Bloch Ed Technip |
| Introduction à l'algorithmique | T. Cormen, C. Leiserson, R. Rivest et T. Stein Ed Dunod |
Modalités d'évaluation
- Examen final
Examen final