BNF203

Outils mathématiques et informatiques pour la génomique


6 crédits Jean-François ZAGURY et Josselin NOIREL EPN07 - Chimie Vivant Santé Unité d'enseignement de type cours

Publié Du 01-09-2012 au 31-08-9999

Prérequis

UE d'informatique, de statistiques, et BNF104 du diplôme d'ingénieur de bio-informatique
Public de niveau Master

Objectifs pédagogiques

Connaitre les données, les outils algorithmiques et statistiques pour le développement des logiciels de traitements des données génomiques et post-génomiques

Contenu

Présentation des approches pour l'alignement des séquences biologiques et de leurs applications
Présentation des bases de données génomiques
Présentation des méthodes de traitement des données génotypiques (SNP, CNV, indel,haplotypes, imputation,génotype, séquençage) et de leurs applications

Applications réalisées en TP de bioinfo avec notamment R et Bioconductor.

 

Modalités de validation

  • Contrôle continu
  • Projet(s)

Description des modalités de validation

Evaluation continue sur projet, travail bibliographique, oraux.

Thésaurus du Cnam :

  • Traitement informatique des données
  • Biotechnologie
  • Bioinformatique
  • Algorithmique
  • Génomique

Thésaurus Formacode :

  • 12008 - bio-informatique

Secrétariat

Libellé
Bioinformatique
Nom du contact
Isabelle Corbeau
Numéros de téléphone
Aucun numéro de téléphone
Adresse postale
17.0.16, 292 rue St Martin
Paris 75003